RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241		Q8TAT8	98 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
PTPA-222	ENST00000445241	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241		J3KRW8	73 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SULT1A2	P50226	295 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	EMP1	P54849	157 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.45	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241		F6UZH7	168 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	AZU1	P20160	251 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	GNG5	P63218	68 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZTC4	211 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.44	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	RGS13	O14921	159 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA7	P01567	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	HTN1	P15515	57 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2G2	P60604	165 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	DAD1	P61803	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	PRR9	Q5T870	116 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	FAM210B	Q96KR6	192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TREM1	Q9NP99	234 aa		10.43	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SNURFL	B1AK76	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	PEX7	O00628	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TDRG1	Q3Y452	100 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.42	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	LCE6A	A0A183	80 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	CBY3	A6NI87	242 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	PRM2	P04554	102 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	PAGE4	O60829	102 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TCL1A	P56279	114 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	SMUG1	Q53HV7	270 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10.4	□□□□□ -0.74
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	KCNS1	Q96KK3	526 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	C18orf15	Q96N68	181 aa		10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF415	Q09FC8	603 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241		Q86TA4	180 aa		10.38	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	IGLL5	B9A064	214 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5G1	P05496	136 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5G3	P48201	142 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2G1	P62253	170 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA5	Q16718	116 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	SPX	Q9BT56	116 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		10.37	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA1	P01562	189 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB130B	P0DP73	79 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB130A	P0DP74	79 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1C3	P42330	323 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	BLOC1S1	P78537	153 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	MUC4	Q99102	2169 aa		10.36	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GV50	99 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK4	O60575	86 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	GCG	P01275	180 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	LTA	P01374	205 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZQT7	251 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf52	Q96A22	123 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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