RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF98A6NK75 572 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 LYRM9A8MSI8 78 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS46E5RG02 174 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 F5H768 121 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 MPDU1O75352 247 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SCO1O75880 301 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 APOC3P02656 99 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SVBPQ8N300 66 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 THAP8Q8NA92 274 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35E1Q96K37 410 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 RSG1Q9BU20 258 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 MLST8Q9BVC4 326 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A22Q9H936 323 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 KCNIP2Q9NS61 270 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 RPRMQ9NS64 109 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SMCO3A2RU48 225 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 F8W036 122 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT2O15120 278 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 GYPEP15421 78 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 FGF7P21781 194 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 ARL16Q0P5N6 197 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 BTN1A1Q13410 526 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 UHRF2Q96PU4 802 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 FAT1Q14517 4588 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 CBY3A6NI87 242 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 FNDC10F2Z333 226 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 INSP01308 110 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 IFNA1P01562 189 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 TSPOP30536 169 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 GALR1P47211 349 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 MEOX2P50222 304 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 DLK1P80370 383 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 GUK1Q16774 197 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SSX7Q7RTT5 188 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 Q9H8V8 135 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 COX11Q9Y6N1 276 aa4.53□□□□□ -1.68
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 H3BRN7 92 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 SNAPINO95295 136 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ATP5G1P05496 136 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ORM2P19652 201 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
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HOXD8-202ENST00000429017 VWC2Q2TAL6 325 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPV4 95 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 FABP1P07148 127 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ADCYAP1P18509 176 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 PPT1P50897 306 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ESRGQ1W209 222 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF738Q8NE65 137 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 OR8A1Q8NGG7 326 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.51□□□□□ -1.69
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HOXD8-202ENST00000429017 LINC01587Q99440 93 aa4.51□□□□□ -1.69
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HOXD8-202ENST00000429017 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0J9YY99 117 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GV50 99 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 C9JQL5 133 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 SFTA3P0C7M3 94 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 HTN1P15515 57 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R60P59551 318 aa4.5□□□□□ -1.69
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