RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0J9YY99 117 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 BBIP1A8MTZ0 92 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARPC5O15511 151 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDE6GP18545 87 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 PCBD1P61457 104 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR8I2Q8N0Y5 310 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR5A2Q8NGI9 324 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCL19Q99731 98 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 JPT1Q9UK76 154 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP54Q70EL1 1684 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PPB8 328 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIR3DP1A8MWS1 328 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 DPM2O94777 84 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCL4P13236 92 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKS2P33552 79 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00208Q96KT6 92 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 BANF2Q9H503 90 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 CALML5Q9NZT1 146 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPC1Q9Y5U8 109 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 MED23Q9ULK4 1368 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-487P-201ENST00000365430 SYNJ1O43426 1573 aa0.53□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM189A5PLL7 270 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL5CA6NH57 179 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 A6NN06 94 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 M0R129 80 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 UQCRQO14949 82 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 LY6G6CO95867 125 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD3DP04234 171 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLAC4Q8WY50 150 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP1S3Q96PC3 154 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1B0GX51 115 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SULT1C4O75897 302 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR2H2O95918 312 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-30P01768 117 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRP9P49458 86 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSPHP78330 225 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF56Q15929 161 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 LYPD5Q6UWN5 251 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZQY7 126 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00299Q6ZSB3 139 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TCTE3Q8IZS6 198 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 C10orf111Q8N326 155 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM7Q9BQ49 75 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 C19orf12Q9NSK7 152 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa0.51□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAV17A0A0B4J275 112 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A0D9SG42 100 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPINT3P49223 89 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKS1BP61024 79 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00575Q6W349 94 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR8J3Q8NGG0 315 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 PYDC1Q8WXC3 89 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 AIF1LQ9BQI0 150 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 BATF3Q9NR55 127 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ANK1P16157 1881 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGEF10O15013 1369 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 A0A1W2PPM0 123 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFITM5A6NNB3 132 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ETV6P41212 452 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNAJB13P59910 316 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 FXYD3Q14802 87 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC153Q494R4 210 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLLU1Q5K131 121 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLYATL3Q5SZD4 288 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM91Q6ZNR0 172 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 IDO2Q6ZQW0 420 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 C5orf56Q8N8D9 126 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 GSKIPQ9P0R6 139 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRP5O75197 1615 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARAP1Q96P48 1450 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBN2P35556 2912 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 265.8 ms