RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 GREM1O60565 184 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 NREPQ16612 68 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SPTSSBQ8NFR3 76 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.14□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 H0YJW9 148 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SBF2Q86WG5 1849 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 MSMBP08118 114 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.13□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 HLA-DMBP28068 263 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZQT7 251 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 A0A0J9YY99 117 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 BAALC-AS2P0C853 105 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 C2orf66Q6UXQ4 117 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.12□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SORL1Q92673 2214 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 RHOHQ15669 191 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SMIM10L1P0DMW3 83 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SMIM10Q96HG1 83 aa13.11□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 COX7B2Q8TF08 81 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 C3orf79P0CE67 100 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 GLRX5Q86SX6 157 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 TM2D2Q9BX73 214 aa13.1□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 PSMB8P28062 276 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 CEND1Q8N111 149 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 RNF126Q9BV68 326 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 FAM231BA6NCW3 169 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 C9orf118A6NHY6 69 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 IGLV2-23P01705 113 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 LMO1P25800 156 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.09□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 C8orf49Q96NF6 230 aa13.08□□□□□ -0.31
NFIC-211ENST00000641145 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 CFPP27918 469 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 FOXE3Q13461 319 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 MESP1Q9BRJ9 268 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 NDUFB8O95169 186 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 ZNF134P52741 427 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 Q8N8P6 123 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 PRR15LQ9BU68 103 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 C1QCP02747 245 aa13.08□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 FOXF2Q12947 444 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 BRK1Q8WUW1 75 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 IGKV1D-12P01611 117 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 GPHB5Q86YW7 130 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 RLFQ13129 1914 aa13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 SRRM5B3KS81 715 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 C9JQL5 133 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 Q86TA4 180 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 A0A0G2JNJ9 132 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 PRSS46E5RG02 174 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 Q9UFV3 132 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 A0A087WW49 117 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 CXCL1P09341 107 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 RNF222A6NCQ9 220 aa13.06□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 Q6ZWC4 215 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 HERV-K104P63124 156 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 ICOSQ9Y6W8 199 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 UBR3Q6ZT12 1888 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 TGFBR3LH3BV60 316 aa13.05□□□□□ -0.32
NFIC-211ENST00000641145 A0A1B0GUS0 222 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 200.7 ms