RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	BCL2	P10415	239 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	RAB14	P61106	215 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	IFITM2	Q01629	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870		Q8TAT8	98 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	XCL2	Q9UBD3	114 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870		J3KRW8	73 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	UBE2C	O00762	179 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	NMB	P08949	121 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	LEP	P41159	167 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF138	P52744	262 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	DEFB135	Q30KP9	77 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TSPO	P30536	169 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	AKR1C3	P42330	323 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	CDKN1B	P46527	198 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	RETN	Q9HD89	108 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF492	Q9P255	531 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	AMBP	P02760	352 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TOR2A	Q5JU69	321 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	RARRES2	Q99969	163 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	SPATA25	Q9BR10	227 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	ZMAT4	Q9H898	229 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	INS	P01308	110 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	UBE2G1	P62253	170 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870		Q6ZWC4	215 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TCF25-223	ENST00000568870	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	SPRY2	O43597	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	PDE6D	O43924	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	GPX1	P07203	203 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	KIR3DS1	Q14943	382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	BTN1A1	Q13410	526 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870		Q86TA4	180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	RNF183	Q96D59	192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TREM1	Q9NP99	234 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	CRISP2	P16562	243 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	CLLU1	Q5K131	121 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	C11orf52	Q96A22	123 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	C7orf71	A4D174	169 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	KLLN	B2CW77	178 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	CEBPG	P53567	150 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	PRR9	Q5T870	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TCF25-223	ENST00000568870	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.11	□□□□□ -0.79

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