RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ATP5L	O75964	103 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGLV2-11	P01706	119 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		F8W735	103 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LY6H	O94772	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1W2PPR1	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CD5L	O43866	347 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00614	P0C842	121 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	APELA	P0DMC3	54 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	C20orf78	Q9BR46	151 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ST20	Q9HBF5	79 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		H7C1H1	209 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SMIM17	P0DL12	118 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SNAI2	O43623	268 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SERF1A	O75920	110 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	NPS	P0C0P6	89 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGLC6	P0CF74	106 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PSMB8	P28062	276 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		A1L4Q6	167 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LINC01546	A6NGU7	62 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PIFO	Q8TCI5	191 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PRELID3A	Q96N28	172 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	C16orf95	Q9H693	158 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LINC01619	G3V211	115 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	LEPROTL1	O95214	131 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-DRB4	P13762	266 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	AP1S3	Q96PC3	154 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		M0R143	59 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TCF21	O43680	179 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFS7	O75251	213 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DDT	P30046	118 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TCL1A	P56279	114 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1W2PRX2	142 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFA7	O95182	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CAMP	P49913	170 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TWIST1	Q15672	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		A0A096LNT2	108 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CKS2	P33552	79 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	HBD	P02042	147 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	GZMB	P10144	247 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MAL	P21145	153 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.52	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RBM23-233	ENST00000557667	SPEG	Q15772	3267 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RBM23-233	ENST00000557667	LINC00587	B1AMM8	73 aa		6.52	□□□□□ -1.37
RBM23-233	ENST00000557667	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
RBM23-233	ENST00000557667	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37

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