RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZRM9	215 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	BTF3L4	Q96K17	158 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RNF24	Q9Y225	148 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.15	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		E5RGE8	158 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	DEDD	O75618	318 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	NXPH3	O95157	252 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM50A	O95807	157 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	FHIT	P49789	147 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RAB11A	P62491	216 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	ICAM4	Q14773	271 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	PRR27	Q6MZM9	219 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TCF24	Q7RTU0	167 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LRTM2	Q8N967	370 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RARRES2	Q99969	163 aa		5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	HELT	A6NFD8	242 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SCGB1D2	O95969	90 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1-17	P01599	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGLC1	P0CG04	106 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	VAMP3	Q15836	100 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TEPP	Q6URK8	271 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IMMP2L	Q96T52	175 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	VSIR	Q9H7M9	311 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RABAC1	Q9UI14	185 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		A0A1B0GV72	72 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		H7BYZ3	331 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IFNA1	P01562	189 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IL4	P05112	153 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CRYBB3	P26998	211 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	GALR1	P47211	349 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZN92	141 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZWC4	215 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	RETN	Q9HD89	108 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SYNGR2	O43760	224 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	PITX3	O75364	302 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	IAPP	P10997	89 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ACER3-213	ENST00000533873	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59

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