RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASCL2Q99929 193 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 G3V4G9 280 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WIPF1O43516 503 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPWQ5EE01 88 aa6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.32□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.32□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.31□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A10P0DMU9 189 aa6.31□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB125Q8N687 156 aa6.31□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR25Q96S07 402 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC11CQ9BY50 192 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF492Q9P255 531 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAT8Q9UHE5 227 aa6.31□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.31□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LTAP01374 205 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DRB4P13762 266 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LEPP41159 167 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADIRFQ15847 76 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OCC1Q8TAD7 63 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TVP23CQ96ET8 276 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TUBA4BQ9H853 241 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.3□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R036 132 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APOC3P02656 99 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPX1P07203 203 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADCYAP1P18509 176 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPOP30536 169 aa6.29□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FXYD7P58549 80 aa6.29□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMUG1Q53HV7 270 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR27Q6MZM9 219 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8N1Y9 231 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C8orf49Q96NF6 230 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.29□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.29□□□□□ -1.4
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5I1Q13606 314 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01551Q86U37 167 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BIN3Q9NQY0 253 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.28□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.27□□□□□ -1.41
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7EN84 100 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R2Z0 102 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCGP01275 180 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV2-8P01709 118 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A1P23297 94 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDKN1BP46527 198 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AMTNQ6UX39 209 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM12Q96EX1 92 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ODF3Q96PU9 254 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MLST8Q9BVC4 326 aa6.27□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.26□□□□□ -1.41
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