RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CACNG7P62955 275 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MSRB1Q9NZV6 116 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PCP4P48539 62 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MINOS1Q5TGZ0 78 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM97Q5BJF2 176 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 Q8N9W7 124 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1N2Q8NGR9 330 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 IFI27L1Q96BM0 104 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ADORA2A-AS1P86434 159 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 C15orf32Q32M92 178 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 ERCC8Q13216 396 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS57Q6UWY2 283 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 TCTAP57738 103 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF185Q96GF1 192 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAC2D3DTV9 90 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC3BP05452 202 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 S100A7P31151 101 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 BOD1L2Q8IYS8 172 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 CNFNQ9BYD5 112 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 IGF2RP11717 2491 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-221ENST00000511747 C7orf71A4D174 169 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 BUB3O43684 328 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 NDUFS7O75251 213 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SEC11AP67812 179 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF502Q8TBZ5 544 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ATRXP46100 2492 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 GAS8-AS1O95177 125 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF182Q8N6D2 247 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 WFDC3Q8IUB2 231 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ECSCRQ19T08 205 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFAND3Q9H8U3 227 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 PPBPP02775 128 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP1LC3AQ9H492 121 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SIRPDQ9H106 197 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIFP30405 207 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 CDKN1BP46527 198 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 DKK2Q9UBU2 259 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB9AP51151 201 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC01559Q495D7 138 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 IL17RELQ6ZVW7 336 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 C18orf15Q96N68 181 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 UQCRFS1P47985 274 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V0E1O15342 81 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-221ENST00000511747 A1L4Q6 167 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GOSR1O95249 250 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TNFRSF6BO95407 300 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CST9LQ9H4G1 147 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RBAKDNA6NC62 111 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 OR9G4Q8NGQ1 327 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 AJUBAQ96IF1 538 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC01546A6NGU7 62 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 LEPP41159 167 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NMUP48645 174 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 DTX2Q86UW9 622 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PCP2Q8IVA1 136 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 EVI2AP22794 236 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SIVA1O15304 175 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GAGE12BA1L429 117 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 G3V318 75 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 UBE2E1P51965 193 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC140Q96MF4 163 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC50A1Q9BRV3 221 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC01548A6NM66 108 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 FCER1GP30273 86 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF151Q2KHN1 245 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 KLK9Q2XQG4 91 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 KLK9Q9UKQ9 250 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PPR1 153 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 A6NDN8 102 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf21Q9P2W6 132 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD52Q0P140 79 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 KLRB1Q12918 225 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SAA4P35542 130 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-221ENST00000511747 OCIAD2Q56VL3 154 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms