RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R129 80 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 RIGQ13278 110 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SP6Q3SY56 376 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF799Q96GE5 643 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PRR25Q96S07 402 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DQA1P01909 254 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 APCSP02743 223 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 STATHP02808 62 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CSN1S1P47710 185 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 INSL3P51460 131 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 Q9HAA7 133 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CMC2Q9NRP2 79 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TAC3Q9UHF0 121 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 PCSK5Q92824 1860 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 NUPR1O60356 82 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 NGFP01138 241 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CD7P09564 240 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL8P80075 99 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LCE4AQ5TA78 99 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 H3BP45 60 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SSR2P43308 183 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 Q75L30 129 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SVILO95425 2214 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PS18 150 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 TIMM23O14925 209 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF20P17024 532 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC29Q8WV35 223 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LYZL4Q96KX0 146 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.77□□□□□ -1.32
RABGGTB-214ENST00000497648 IGLL5B9A064 214 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 H0YGG7 62 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 NDUFS7O75251 213 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TCL1BO95988 128 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ERVK-16P61578 105 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 Q6P435 159 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 CCL17Q92583 94 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 DSCR8Q96T75 97 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RNF126Q9BV68 326 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TENM4Q6N022 2769 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRK2Q5S007 2527 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAV17A0A0B4J275 112 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C12orf73Q69YU5 71 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 NFE4Q86UQ8 179 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TOMM6Q96B49 74 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 TRGV9Q99603 122 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 C4orf51C9J302 202 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGGTB-214ENST00000497648 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms