RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS46	E5RG02	174 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BTX0	84 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PITX3	O75364	302 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1G2	O95670	118 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLA	Q13239	276 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	IL18	Q14116	193 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ARV1	Q9H2C2	271 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO0255	Q9UI72	69 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EP13	123 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAF2	O60831	178 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYGD	P07320	174 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SRI	P30626	198 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511		E5RGE8	158 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	GOSR2	O14653	212 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CT45A10	P0DMU9	189 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A6	P12236	298 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PLP1	P60201	277 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF415	Q09FC8	603 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf71	A4D174	169 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A3	O00476	420 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINK4	O60575	86 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXB5	P09067	269 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYBA4	P53673	196 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF3	Q96PU9	254 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TCL1A	P56279	114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf46	Q504U0	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PATE2	Q6UY27	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF546	Q86UE3	836 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N814	137 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9HAA7	133 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDSP2	O14595	271 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CTDSPL	O15194	276 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MPDU1	O75352	247 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	GPX1	P07203	203 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN1A1	Q13410	526 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	VGLL1	Q99990	258 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EQD1	137 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SSSCA1	O60232	199 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC8	Q13216	396 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BQ15	152 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT2	O15120	278 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QB	P02746	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	ORM1	P02763	201 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4E1	P0C645	316 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PPT1	P50897	306 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TIRAP	P58753	221 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CD300C	Q08708	224 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	OPCML	Q14982	345 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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