RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF253O75346 499 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TSPAN9O75954 239 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 KRTAP10-3P60369 221 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 PRR25Q96S07 402 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 METTL26Q96S19 204 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 S100PP25815 95 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CTAG1AP78358 180 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 DCANP1Q8TF63 244 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TSKUQ8WUA8 353 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 RCHY1Q96PM5 261 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 LY6G6DO95868 133 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 PSG9Q00887 426 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 FOXE3Q13461 319 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC21Q5SSG8 566 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SMIM12Q96EX1 92 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 PGLYRP4Q96LB8 373 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 PRELID1Q9Y255 219 aa3.64□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MTORP42345 2549 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC4Q99102 2169 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SNURFLB1AK76 121 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SPRY2O43597 315 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CT45A10P0DMU9 189 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SYNJ2BPP57105 145 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM19A4Q96LR4 140 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SMPXQ9UHP9 88 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 XKRY2A2RUG3 117 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 AMBPP02760 352 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 IQCJQ1A5X6 159 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 BTF3L4Q96K17 158 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.63□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ANK2Q01484 3957 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 GAS8-AS1O95177 125 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CD28P10747 220 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 PYY3Q5JQD4 70 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0G2JLM5 398 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM89A2RUT3 159 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 A8MWP6 167 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 P01737 135 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 AKR1D1P51857 326 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF124Q15973 351 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM209BQ5JX69 171 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 WFDC12Q8WWY7 111 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 M0QZ24 198 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CD33P20138 364 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CT83Q5H943 113 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 RNF24Q9Y225 148 aa3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 C2orf70A6NJV1 201 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 K7EMT4 169 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 S100A6P06703 90 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 ELANEP08246 267 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 FABP4P15090 132 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 CAMPP49913 170 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 REC114Q7Z4M0 266 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 RAX2Q96IS3 184 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 C16orf92Q96LL3 132 aa3.61□□□□□ -1.83
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms