RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 C7orf71A4D174 169 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC1Q9HC57 220 aa11.79□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF503Q96F45 646 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 VGLL1Q99990 258 aa11.78□□□□□ -0.52
SH3BP4-211ENST00000493436 SNURFLB1AK76 121 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 KLLNB2CW77 178 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 CD300CQ08708 224 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF212Q495C1 297 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 KHDC3LQ587J8 217 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 MED28Q9H204 178 aa11.77□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 M0R2N4 97 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GPX1P07203 203 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 CRISP2P16562 243 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 TAS2R45P59539 299 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RANP62826 216 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 BTN1A1Q13410 526 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 Q9H3A6 140 aa11.76□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT3O95989 172 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 CSN1S1P47710 185 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF492Q9P255 531 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.75□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE12BA1L429 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE7O76087 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 NMBP08949 121 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE12FP0CL80 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE12GP0CL81 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE12IP0CL82 117 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 M6PRP20645 277 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ATG101Q9BSB4 218 aa11.74□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PPV4 95 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF138P52744 262 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR9Q5T870 116 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8TAT8 98 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.73□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RBAKDNA6NC62 111 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS13O14921 159 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB2AP61019 212 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 OR5I1Q13606 314 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.72□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC4Q99102 2169 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF266Q14584 549 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZTI0 123 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 HYLS1Q96M11 299 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 AQP10Q96PS8 301 aa11.71□□□□□ -0.53
SH3BP4-211ENST00000493436 DIRC3C9JPN6 131 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 Q5BKY6 102 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZQT7 251 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZR54 194 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 OTORQ9NRC9 128 aa11.7□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 PGPA6NDG6 321 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXA5P20719 270 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB13Q8WXK3 278 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.69□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0J9YY99 117 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL8CO15255 209 aa11.68□□□□□ -0.54
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110 ms