RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAC2D3DTV9 90 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 PRM2P04554 102 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 PYYP10082 97 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS2R60P59551 318 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 PDE6HQ13956 83 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 ODF3Q96PU9 254 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC01587Q99440 93 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CTDSPL-208ENST00000486978 HSPB11Q9Y547 144 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.55□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 NACAE9PAV3 2078 aa4.54□□□□□ -1.68
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CTDSPL-208ENST00000486978 P0DMU3 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM231AP0DMU4 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM231CP0DMU5 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 HTN3P15516 51 aa4.54□□□□□ -1.68
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CTDSPL-208ENST00000486978 LEPP41159 167 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 BLNKQ8WV28 456 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 C16orf74Q96GX8 76 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 ALG5Q9Y673 324 aa4.54□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 M0R3E3 92 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 OR7C2O60412 319 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 CT45A10P0DMU9 189 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB130BP0DP73 79 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 DEFB130AP0DP74 79 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 HTN1P15515 57 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 ERCC8Q13216 396 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 ICAM4Q14773 271 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 KIR3DS1Q14943 382 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZR54 194 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.53□□□□□ -1.68
CTDSPL-208ENST00000486978 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSPL-208ENST00000486978 FUT9Q9Y231 359 aa4.53□□□□□ -1.68
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CTDSPL-208ENST00000486978 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 C7orf71A4D174 169 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSPL-208ENST00000486978 J3KRW8 73 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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CTDSPL-208ENST00000486978 OR10J4P0C629 311 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM88Q6PEY1 159 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSPL-208ENST00000486978 FXYD5Q96DB9 178 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 LINC00477Q96M19 166 aa4.52□□□□□ -1.69
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CTDSPL-208ENST00000486978 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 MED28Q9H204 178 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 WFDC1Q9HC57 220 aa4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 LRP2P98164 4655 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 SNURFLB1AK76 121 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 KLLNB2CW77 178 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 F5H768 121 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP5G1P05496 136 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 NMBP08949 121 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 CRISP2P16562 243 aa4.51□□□□□ -1.69
CTDSPL-208ENST00000486978 M6PRP20645 277 aa4.51□□□□□ -1.69
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