RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 ATP6V0BQ99437 205 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SNAI2O43623 268 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFS7O75251 213 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 AZU1P20160 251 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 MFAP4P55083 255 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PDE6HQ13956 83 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 VMO1Q7Z5L0 202 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 Q8N6K4 173 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 AP1S3Q96PC3 154 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 A0A087X0K7 114 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 A6NJY4 79 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SMKR1H3BMG3 65 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 GAS8-AS1O95177 125 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PRR25Q96S07 402 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 CEACAM3P40198 252 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PAX8Q06710 450 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM189A5PLL7 270 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 M0R1W7 72 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 CT45A10P0DMU9 189 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 U3KQK5 164 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 TCTAP57738 103 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 AJUBAQ96IF1 538 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SIGMAR1Q99720 223 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PRAC2D3DTV9 90 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 K7EP34 96 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM17P0DL12 118 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 Q6AWC8 147 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 FA2HQ7L5A8 372 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 NPYP01303 97 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 GPR183P32249 361 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 RAB9AP51151 201 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 Q8N9W7 124 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 TIMD4Q96H15 378 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 PRELID3AQ96N28 172 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1B0GW15 77 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 C9orf118A6NHY6 69 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 LINC01548A6NM66 108 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 FGF6P10767 208 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 SEC11AP67812 179 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 ERCC8Q13216 396 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 EBI3Q14213 229 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 RNF182Q8N6D2 247 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 IGLC6P0CF74 106 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 CSN1S1P47710 185 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 ORMDL3Q8N138 153 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 JMJD8Q96S16 334 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 COX8AP10176 69 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 THYN1Q9P016 225 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ITPR1Q14643 2758 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CKS1BP61024 79 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TWIST1Q15672 202 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 C15orf32Q32M92 178 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 RNF185Q96GF1 192 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 SIRPDQ9H106 197 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 RABAC1Q9UI14 185 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 H3BRM9 83 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-214ENST00000473778 H3BUT2 72 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms