RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 MGST3O14880 152 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 GCHFRP30047 84 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF138P52744 262 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CALYQ9NYX4 217 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ANAPC10Q9UM13 185 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMA5O15230 3695 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PGPA6NDG6 321 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GWA3 101 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 BGLAPP02818 100 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINT3P49223 89 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 FHL2Q14192 279 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 F5P12259 2224 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM131Q92545 1883 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 BUB3O43684 328 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFS7O75251 213 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV3-27P01718 113 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NNATQ16517 81 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR86Q86TI4 376 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C18orf12Q96KH6 178 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf62A8K5M9 175 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 WISP1O95388 367 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 THAP8Q8NA92 274 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 FREM3P0C091 2139 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL16O15467 120 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NPC2P61916 151 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PAX8Q06710 450 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ERCC8Q13216 396 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 NT5CQ8TCD5 201 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 HES3Q5TGS1 186 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM57BQ71RH2 274 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR15Q8IV56 129 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM14DPA8MWL7 114 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf94C9JXX5 98 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-DQA1P01909 254 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZR03 302 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A22Q9H936 323 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 V9GYV3 84 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1GO43497 2377 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 P0DMU3 169 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM231AP0DMU4 169 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM231CP0DMU5 169 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 HBG2P69892 147 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD3Q14802 87 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZS49 121 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TAC3Q9UHF0 121 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 F6UB75 175 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXQ1Q9C009 403 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LRP4O75096 1905 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CEP250Q9BV73 2442 aa5.27□□□□□ -1.57
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RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A20O43772 301 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYGSP22914 178 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FER1L5A0AVI2 2057 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FCER1GP30273 86 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 NABP2Q9BQ15 211 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FXYD4P59646 89 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GXF2 115 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 UPK2O00526 184 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF524Q96C55 264 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9H8V8 135 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PQD3 144 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01549A6NIU2 74 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IL4P05112 153 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.25□□□□□ -1.57
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