RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PMVKQ15126 192 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM249Q2WGJ8 235 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SELLP14151 372 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TECTAO75443 2155 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 COX11Q9Y6N1 276 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM219Q86XT9 240 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 Q8N8P6 123 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1-69P01742 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TAL2Q16559 108 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 GATD1Q8NB37 220 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C20orf78Q9BR46 151 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 VSIRQ9H7M9 311 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SPXQ9BT56 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NUP210LQ5VU65 1888 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CD5LO43866 347 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 HERVK_113P63121 156 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 UTF1Q5T230 341 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LTBP2Q14767 1821 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ELANEP08246 267 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 F8W1H4 67 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C3orf56Q8N813 242 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LY6DQ14210 128 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SOCS3O14543 225 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CXCL1P09341 107 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MUC4Q99102 2169 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RIPPLY3P57055 190 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GUS0 222 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CD24P25063 80 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 KIR3DS1Q14943 382 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 COL4A6Q14031 1691 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 H3BRN7 92 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 OVOL3O00110 214 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NCR2O95944 276 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 REG4Q9BYZ8 158 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1-16P04430 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ATP6V0E1O15342 81 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 GNLYP22749 145 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 DAD1P61803 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 UBE2V1Q13404 147 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 Q8TAT8 98 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NTF4P34130 210 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF134P52741 427 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RHOHQ15669 191 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 THAP8Q8NA92 274 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF114Q8NC26 417 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C8orf86Q6ZUL3 223 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SIVA1O15304 175 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM243Q9BU79 118 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 A0A087WV48 116 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PCDH15Q96QU1 1955 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV1-44P01699 117 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 UBL5Q9BZL1 73 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 A8MWP6 167 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 E7EQL1 145 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 LYNX1P0DP58 116 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 HLA-DRB4P13762 266 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRT-201ENST00000356100 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.83□□□□□ -1.64
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