RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.26□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ARV1Q9H2C2 271 aa11.26□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 MED9Q9NWA0 146 aa11.26□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WTM6 91 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 RAB5CP51148 216 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 RAB11AP62491 216 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00052Q96N35 136 aa11.25□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 WFDC1Q9HC57 220 aa11.25□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.24□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ESRGQ1W209 222 aa11.24□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.24□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.23□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 ID1P41134 155 aa11.23□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf173Q96LM9 149 aa11.23□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 UMAD1C9J7I0 102 aa11.22□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 FABP1P07148 127 aa11.22□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 FAM78BQ5VT40 261 aa11.22□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa11.22□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.22□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.22□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.22□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.21□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 AMTNQ6UX39 209 aa11.21□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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SPCS1-201ENST00000233025 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.21□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.21□□□□□ -0.61
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF98A6NK75 572 aa11.19□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 TSPOP30536 169 aa11.19□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 MEOX2P50222 304 aa11.19□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.19□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.19□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.19□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 RAB19A4D1S5 217 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 TEX46H3BTG2 121 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 GALR1P47211 349 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 RAB2AP61019 212 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 ARL16Q0P5N6 197 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf92Q96LL3 132 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A22Q9H936 323 aa11.18□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 SMCO3A2RU48 225 aa11.17□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 SERF2P84101 59 aa11.17□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.17□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.17□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.17□□□□□ -0.62
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SPCS1-201ENST00000233025 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 ORM2P19652 201 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1C1Q04828 323 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 UQCC3Q6UW78 93 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.16□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 MPDU1O75352 247 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 MBP02144 154 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 AZU1P20160 251 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 M6PRP20645 277 aa11.15□□□□□ -0.62
SPCS1-201ENST00000233025 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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