RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 LGALS7P47929 136 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 CD69Q07108 199 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 ORMDL3Q8N138 153 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 Q8TCH9 128 aa7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-222ENST00000621217 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-222ENST00000621217 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-222ENST00000621217 AREGP15514 252 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 AZU1P20160 251 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-222ENST00000621217 NUP37Q8NFH4 326 aa7.34□□□□□ -1.23
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GGA3-222ENST00000621217 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 NACAE9PAV3 2078 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 IGHV3-11P01762 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 FAM106CPP0CH98 169 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 CDSNQ15517 529 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 PRSS47A8MTI9 375 aa7.31□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 Q6ZVH6 145 aa7.31□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 ETDBQ3ZM63 59 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 ADAMTS20P59510 1910 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 LAMA5O15230 3695 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 FMC1Q96HJ9 113 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 A0A1W2PPI3 338 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 WT1-ASQ06250 92 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-222ENST00000621217 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 MORN5Q5VZ52 161 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-222ENST00000621217 HAX1O00165 279 aa7.29□□□□□ -1.24
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