RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CENPXA8MT69 81 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SMKR1H3BMG3 65 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 H3BQF6 201 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 C15orf65H3BRN8 121 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 M0QXV9 152 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 GABRPO00591 440 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 FKBP6O75344 327 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PIAS1O75925 651 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TNFAIP8O95379 198 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 NAPSAO96009 420 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 DHFRP00374 187 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PRM2P04554 102 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PFN1P07737 140 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 RAB3AP20336 220 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 HSD11B1P28845 292 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 KCNJ3P48549 501 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 BLVRAP53004 296 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MYL5Q02045 173 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MXD1Q05195 221 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ATP6V1FQ16864 119 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PSMG4Q5JS54 123 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SLC25A26Q70HW3 274 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 DCXRQ7Z4W1 244 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 FUNDC1Q8IVP5 155 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 OR8J2Q8NGG1 315 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PFN4Q8NHR9 129 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CMTM2Q8TAZ6 248 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 OR51E1Q8TCB6 317 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 DCANP1Q8TF63 244 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ARL11Q969Q4 196 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SLAMF6Q96DU3 332 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CCDC42Q96M95 316 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 Q96MT0 163 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SCGB3A2Q96PL1 93 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 VSIRQ9H7M9 311 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IFT46Q9NQC8 304 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MCUBQ9NWR8 336 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ST3GAL6Q9Y274 331 aa0.93□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TRAV27A0A087WT01 109 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PRORSD1PA6NEY8 169 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 FABP12A6NFH5 140 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 A6NN06 94 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 C5orf58C9J3I9 102 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 H3BN98 237 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SULT1C2O00338 296 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 NME4O00746 187 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 DEGS1O15121 323 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ORC5O43913 435 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 KRT75O95678 551 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CYB5AP00167 134 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-30P01768 117 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-33P01772 117 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGKV1-16P04430 117 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 S100A6P06703 90 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CT45A6P0DMU7 189 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CT45A5P0DMU8 189 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CT45A7P0DMV0 189 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CD36P16671 472 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PPIBP23284 216 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SRIP30626 198 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ETV6P41212 452 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 RANBP1P43487 201 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PSG9Q00887 426 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TPBGQ13641 420 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 DGCR6Q14129 220 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CASP8Q14790 479 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 RSU1Q15404 277 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MAPRE2Q15555 327 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 ZNF726P1Q15940 193 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 PSG3Q16557 428 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TAL2Q16559 108 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 RTL8BQ17RB0 113 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 CLVS2Q5SYC1 327 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TMEM42Q69YG0 159 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 AHSA2Q719I0 299 aa0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RRN3-204ENST00000561685 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.9 ms