RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 C11orf94C9JXX5 98 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 F6UB75 175 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 CD5P06127 495 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 CD7P09564 240 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 KRTAP10-11P60412 298 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PSG3Q16557 428 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PSMG4Q5JS54 123 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 LCN12Q6JVE5 192 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 COMMD7Q86VX2 200 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 LINC00052Q96N35 136 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 MED9Q9NWA0 146 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 VAX2Q9UIW0 290 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 OR4C46A6NHA9 309 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 IFNA1P01562 189 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PPT1P50897 306 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 DEFB131AP59861 70 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PAFAH1B2P68402 229 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PSG9Q00887 426 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ZNF738Q8NE65 137 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SGK494Q96LW2 274 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 LINC00479Q96M42 142 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ASCL2Q99929 193 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 DERL1Q9BUN8 251 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 EPDR1Q9UM22 224 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RAB19A4D1S5 217 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 KNCNA6PVL3 124 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 DIRC3C9JPN6 131 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PEX7O00628 323 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 IGLV2-11P01706 119 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 TCRAP04437 139 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ERCC8Q13216 396 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 C11orf52Q96A22 123 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 CITED4Q96RK1 184 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PRR25Q96S07 402 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 VGLL1Q99990 258 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 AGRNO00468 2067 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ID1P41134 155 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 Q8N1Y9 231 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 Q8TAT8 98 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 ATG101Q9BSB4 218 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 TREM1Q9NP99 234 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 PRELID1Q9Y255 219 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-216ENST00000549221 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 A0A0J9YX75 114 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 F6UZH7 168 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 PDE6DO43924 150 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 ADCYAP1P18509 176 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 CEBPGP53567 150 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 PEA15Q15121 130 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 DEFB125Q8N687 156 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 TVP23CQ96ET8 276 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 PARLQ9H300 379 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-216ENST00000549221 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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