RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 LINC00315P59091 139 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 Q6ZTI0 123 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 A0A096LPF7 62 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 EPM2AB3EWF7 344 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 CT45A10P0DMU9 189 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 S100A5P33763 92 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 MORN5Q5VZ52 161 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.7□□□□□ -0.54
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CS-214ENST00000548849 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.69□□□□□ -0.54
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CS-214ENST00000548849 OR4E1P0C645 316 aa11.69□□□□□ -0.54
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CS-214ENST00000548849 ARL16Q0P5N6 197 aa11.69□□□□□ -0.54
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CS-214ENST00000548849 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 H3BQ15 152 aa11.68□□□□□ -0.54
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CS-214ENST00000548849 TAS2R30P59541 319 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 ODF3Q96PU9 254 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 MGST2Q99735 147 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 GGACTQ9BVM4 153 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 SIVA1O15304 175 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 INPP1P49441 399 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 C4orf46Q504U0 113 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 FAT1Q14517 4588 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 EREGO14944 169 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 GUK1Q16774 197 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 Q6ZRG5 221 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 C7orf66A4D0T2 115 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 CAMLGP49069 296 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 RAB31Q13636 194 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 FUT9Q9Y231 359 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-214ENST00000548849 C7orf71A4D174 169 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 L7N2F9 121 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 MBPP02686 304 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ERVFC1-1P60608 527 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 VAMP2P63027 116 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ERCC8Q13216 396 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 MIC13Q5XKP0 118 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 C11orf72Q8NBR9 251 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 OR1L4Q8NGR5 311 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 C18orf15Q96N68 181 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CCDC160A6NGH7 325 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 PAX4O43316 350 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 NXPH4O95158 308 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 BCAP31P51572 246 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 BTN1A1Q13410 526 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 BAK1Q16611 211 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TRIQKQ629K1 86 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.63□□□□□ -0.55
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CS-214ENST00000548849 KLF12Q9Y4X4 402 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 M0R3E3 92 aa11.62□□□□□ -0.55
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CS-214ENST00000548849 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CD300CQ08708 224 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 PFDN5Q99471 154 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 SPINK4O60575 86 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 XGP55808 180 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 MITD1Q8WV92 249 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 LINC00477Q96M19 166 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-214ENST00000548849 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.6□□□□□ -0.55
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