RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 FRZBQ92765 325 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 SFRP2Q96HF1 295 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 C17orf77Q96MU5 243 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 OR5B12Q96R08 314 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 IMMP2LQ96T52 175 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 TXN2Q99757 166 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 CHRDL1Q9BU40 450 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 V9GYV3 84 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 ABCA4P78363 2273 aa4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
TRDN-205ENST00000546248 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 A0A1B0GUV1 79 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF98A6NK75 572 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SLC17A3O00476 420 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 PEX7O00628 323 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 UBE2CO00762 179 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BUB3O43684 328 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GNG7O60262 68 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BKO60814 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TYMSP04818 313 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IL4P05112 153 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BJP06899 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FABP1P07148 127 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGLC2P0DOY2 106 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BOP23527 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 S100PP25815 95 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BBP33778 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 NDUFA6P56556 154 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BDP58876 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ERVFC1-1P60608 527 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BCP62807 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GAGE2BQ13066 116 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GAGE2EQ4V326 116 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 Q56UQ5 140 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CENPWQ5EE01 88 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF600Q6ZNG1 722 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BAGE2Q86Y30 109 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF502Q8TBZ5 544 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BLNKQ8WV28 456 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 Q9H3A6 140 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 OSTCQ9NRP0 149 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IL36BQ9NZH7 164 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 THYN1Q9P016 225 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ITPR1Q14643 2758 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RELNP78509 3460 aa4.15□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PPQ1 181 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ZNF320A2RRD8 509 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 OR2T8A6NH00 312 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 H3BUX3 64 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ISLRO14498 428 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGF1P05019 195 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 GNG4P50150 75 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 BLCAPP62952 87 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RHOGP84095 191 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LY6EQ16553 131 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 ECSCRQ19T08 205 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 SGK494Q96LW2 274 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 MS4A10Q96PG2 267 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 OTORQ9NRC9 128 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 NBASA2RRP1 2371 aa4.14□□□□□ -1.75
TRDN-205ENST00000546248 TNCP24821 2201 aa4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.8 ms