RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491712.2

SPTAN1-208, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-208ENST00000491712 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 ATG101Q9BSB4 218 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.55□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 IGSF23A1L1A6 192 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SLC17A3O00476 420 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 MORN5Q5VZ52 161 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 ODF3Q96PU9 254 aa9.54□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 CBY3A6NI87 242 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 E5RGE8 158 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 F5H768 121 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 H3BQ15 152 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 H3BTX0 84 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 UPK1BO75841 260 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 IL15RAQ13261 267 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 PDE6HQ13956 83 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 NMES1Q9C002 83 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 PRELID1Q9Y255 219 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.53□□□□□ -0.88
SPTAN1-208ENST00000491712 SNURFLB1AK76 121 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 M0R2N4 97 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PRM2P04554 102 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PET100P0DJ07 73 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 AZU1P20160 251 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.52□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 DEFA1P59665 94 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 DEFA3P59666 94 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.51□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PRAC2D3DTV9 90 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 NUDT3O95989 172 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 CCL18P55774 89 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 THAP6Q8TBB0 222 aa9.5□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 J3KRW8 73 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 NHLH2Q02577 135 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 CLINT1Q14677 625 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 FCN2Q15485 313 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 BLNKQ8WV28 456 aa9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 SSNA1O43805 119 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 SIX6O95475 246 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 CT45A10P0DMU9 189 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 TMEM78Q5T7P6 136 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 LINC00477Q96M19 166 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 C7orf71A4D174 169 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 PYYP10082 97 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 KIR3DS1Q14943 382 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 Q6ZR54 194 aa9.47□□□□□ -0.89
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SPTAN1-208ENST00000491712 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 NACAE9PAV3 2078 aa9.47□□□□□ -0.89
SPTAN1-208ENST00000491712 GAGE12BA1L429 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 M0R3E3 92 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 RTL8CO15255 209 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GAGE7O76087 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 NDUFB4O95168 129 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 NMBP08949 121 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GAGE12FP0CL80 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GAGE12GP0CL81 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GAGE12IP0CL82 117 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 M6PRP20645 277 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 OR5I1Q13606 314 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.46□□□□□ -0.9
SPTAN1-208ENST00000491712 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
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