RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	BLNK	Q8WV28	456 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	PRELID1	Q9Y255	219 aa		12.52	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YX75	114 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BQ15	152 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF182	Q8N6D2	247 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF141	Q8WVD5	230 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf173	Q96LM9	149 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		12.51	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV3-20	P01619	116 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	PYY	P10082	97 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	HYLS1	Q96M11	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MTW9	85 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BTX0	84 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L11	O43521	198 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	C1QB	P02746	253 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB2A	P61019	212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6G6C	O95867	125 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	AMBP	P02760	352 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10J4	P0C629	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TMUB2	Q71RG4	321 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		12.48	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424		F6UB75	175 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CSN1S1	P47710	185 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		12.47	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC17A3	O00476	420 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CXorf1	O96002	111 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-DMB	P28068	263 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB24	Q969Q5	203 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD5	Q96DB9	178 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	XCL2	Q9UBD3	114 aa		12.46	□□□□□ -0.41
HDAC10-216	ENST00000489424	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB1	P60022	68 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP69	Q49AA0	526 aa		12.45	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	UMAD1	C9J7I0	102 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB4A	O15263	64 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB4	O95168	129 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC11B	P0C7V7	166 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPO	P30536	169 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ICAM4	Q14773	271 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		12.44	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	STOML3	Q8TAV4	291 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		12.43	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD7	P58549	80 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM210B	Q96KR6	192 aa		12.42	□□□□□ -0.42
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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