RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 TRIM63Q969Q1 353 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 UPK3BQ9BT76 320 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FAT1Q14517 4588 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 A0A087X0K7 114 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SMIM18P0DKX4 95 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SLC25A6P12236 298 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 HOXA5P20719 270 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ERVFC1-1P60608 527 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF503Q96F45 646 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ARL6Q9H0F7 186 aa7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 H3BTX0 84 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SSSCA1O60232 199 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TNFRSF6BO95407 300 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 LCN15Q6UWW0 184 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 MCFD2Q8NI22 146 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 PSENENQ9NZ42 101 aa7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 CCNKO75909 580 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SFT2D2O95562 160 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SELENOTP62341 195 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 PPP1R1AQ13522 171 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 Q5VSD8 79 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZTI0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 LRTM2Q8N967 370 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SYT8Q8NBV8 401 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FRZBQ92765 325 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ARV1Q9H2C2 271 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.1□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FABP12A6NFH5 140 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SLC17A3O00476 420 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SIVA1O15304 175 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 CXCL2P19875 107 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 LEPP41159 167 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 AP3S2P59780 193 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 PYDC2Q56P42 97 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 RNF24Q9Y225 148 aa7.09□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 MYCBP2O75592 4640 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 A0A096LPF7 62 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PRAC2D3DTV9 90 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 H3BNG1 76 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 GOSR2O14653 212 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 COX7A2P2O60397 106 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 NXPH4O95158 308 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 IFNA5P01569 189 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PLP1P60201 277 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 NHLH2Q02577 135 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PATE2Q6UY27 113 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.08□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 IGHV3-53P01767 116 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF546Q86UE3 836 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.07□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 AGPAT2O15120 278 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 CT45A10P0DMU9 189 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 TNFSF8P32971 234 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF680Q8NEM1 530 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 FUT9Q9Y231 359 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.06□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 C7orf71A4D174 169 aa7.05□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 PAX4O43316 350 aa7.05□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 XGP55808 180 aa7.05□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 HAMPP81172 84 aa7.05□□□□□ -1.28
DDX39B-220ENST00000482195 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms