RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 SLC50A1Q9BRV3 221 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 GGACTQ9BVM4 153 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.72□□□□□ -1.49
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0J9YY99 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IGSF23A1L1A6 192 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE12BA1L429 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SNURFLB1AK76 121 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 H3BQ15 152 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE7O76087 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RLN2P04090 185 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5G1P05496 136 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE12FP0CL80 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE12GP0CL81 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GAGE12IP0CL82 117 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 S100A11P31949 105 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5G3P48201 142 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SULT1A1P50225 295 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TAS2R60P59551 318 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OXA1LQ15070 435 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 THAP6Q8TBB0 222 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf74Q96GX8 76 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 FAM210BQ96KR6 192 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PFDN5Q99471 154 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC32Q9BV29 185 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 A8MTW9 85 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 H7BYZ3 331 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PYYP10082 97 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CXCL2P19875 107 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LEPP41159 167 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ERCC8Q13216 396 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 S100ZQ8WXG8 99 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.7□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CBY3A6NI87 242 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 M0R3E3 92 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RTL8CO15255 209 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CT45A10P0DMU9 189 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 CCL18P55774 89 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 NHLH2Q02577 135 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GUK1Q16774 197 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RNF212Q495C1 297 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.69□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SSNA1O43805 119 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GPX1P07203 203 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OR10J4P0C629 311 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IGLC2P0DOY2 106 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ICAM4Q14773 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1FQ16864 119 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.68□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 E5RGE8 158 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RGS13O14921 159 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 OR7C2O60412 319 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 BTN1A1Q13410 526 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 ASAH1Q13510 395 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SSX7Q7RTT5 188 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RNF141Q8WVD5 230 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.67□□□□□ -1.5
CTPS1-209ENST00000480420 C7orf71A4D174 169 aa5.66□□□□□ -1.5
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