RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	RNF222	A6NCQ9	220 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		G3V3Q6	166 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TAS2R45	P59539	299 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	RHOB	P62745	196 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SERF2	P84101	59 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	PSG9	Q00887	426 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF345	Q14585	488 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	KHDC3L	Q587J8	217 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	AMTN	Q6UX39	209 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		Q8NAQ8	132 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR11H2	Q8NH07	326 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ODF3	Q96PU9	254 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	FUT9	Q9Y231	359 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	PRELID1	Q9Y255	219 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		A0A0J9YWU9	116 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		H3BQ15	152 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SLC17A3	O00476	420 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TAAR5	O14804	337 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	MB	P02144	154 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	M6PR	P20645	277 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	MFF	Q9GZY8	342 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	WFDC1	Q9HC57	220 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		X6R8D5	127 aa		6.07	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TMEM189	A5PLL7	270 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	NUPR2	A6NF83	97 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	HMSD	A8MTL9	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		F6UB75	175 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		Q5BKY6	102 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR51M1	Q9H341	326 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		6.06	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	JTB	O76095	146 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	NDUFB4	O95168	129 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	INS	P01308	110 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	CDKN1B	P46527	198 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	DEFB1	P60022	68 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	PAXX	Q9BUH6	204 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	XCL2	Q9UBD3	114 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	OR7C2	O60412	319 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	NMB	P08949	121 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	PYY	P10082	97 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ATP6V0C	P27449	155 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TSPO	P30536	169 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	RFNG	Q9Y644	331 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	LYST	Q99698	3801 aa		6.04	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		A0A0D9SG52	128 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128		A0A1W2PPV4	95 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	C11orf94	C9JXX5	98 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	ARPC5	O15511	151 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	IGKV3-20	P01619	116 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	STAG3L2	P0CL84	134 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	STAG3L3	P0CL85	134 aa		6.03	□□□□□ -1.44
USP34-208	ENST00000467128	HLA-DMB	P28068	263 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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