RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 INSP01308 110 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 HTN1P15515 57 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RAB2AP61019 212 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TMEM78Q5T7P6 136 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 HYLS1Q96M11 299 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 HMSDA8MTL9 139 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SLC17A3O00476 420 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 DEFB4AO15263 64 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 HBE1P02100 147 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 LEPP41159 167 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 EMP1P54849 157 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 PMS2P11Q13670 270 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 AKAP14Q86UN6 197 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 STOML3Q8TAV4 291 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 LINC01587Q99440 93 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 COL7A1Q02388 2944 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TMEM189A5PLL7 270 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RNF222A6NCQ9 220 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 J3KRW8 73 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 K7EQM0 130 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 M0R2Z0 102 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 CXorf1O96002 111 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 CDKN1BP46527 198 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RRN3P1Q2M238 152 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RAB24Q969Q5 203 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 LINC00477Q96M19 166 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RFNGQ9Y644 331 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 PGPA6NDG6 321 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 ZNF345Q14585 488 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZNX1 250 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TMUB2Q71RG4 321 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 FXYD5Q96DB9 178 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 Q9H3A6 140 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 OTORQ9NRC9 128 aa6.97□□□□□ -1.29
PKP4-208ENST00000462335 PRAC2D3DTV9 90 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 M0R3E3 92 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 BCL2L11O43521 198 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 NDUFB4O95168 129 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 IFNA7P01567 189 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 GPX1P07203 203 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.96□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 NUPR2A6NF83 97 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 UMAD1C9J7I0 102 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 TEX46H3BTG2 121 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 GCHFRP30047 84 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 ERCC8Q13216 396 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 ZFP69Q49AA0 526 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 CASC10Q5T4H9 136 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 BAP18Q8IXM2 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.95□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PKP4-208ENST00000462335 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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