RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	INS	P01308	110 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	HTN1	P15515	57 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RAB2A	P61019	212 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	HYLS1	Q96M11	299 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	HMSD	A8MTL9	139 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SLC17A3	O00476	420 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	DEFB4A	O15263	64 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	HBE1	P02100	147 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	LEP	P41159	167 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	EMP1	P54849	157 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	PMS2P11	Q13670	270 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	AKAP14	Q86UN6	197 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	STOML3	Q8TAV4	291 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	LINC01587	Q99440	93 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	COL7A1	Q02388	2944 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM189	A5PLL7	270 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RNF222	A6NCQ9	220 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335		J3KRW8	73 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335		K7EQM0	130 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335		M0R2Z0	102 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	CXorf1	O96002	111 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	CDKN1B	P46527	198 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RRN3P1	Q2M238	152 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	LINC00477	Q96M19	166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RFNG	Q9Y644	331 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	PGP	A6NDG6	321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF345	Q14585	488 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335		Q6ZNX1	250 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TMUB2	Q71RG4	321 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	FXYD5	Q96DB9	178 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335		Q9H3A6	140 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	OTOR	Q9NRC9	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PKP4-208	ENST00000462335	PRAC2	D3DTV9	90 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335		M0R3E3	92 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	BCL2L11	O43521	198 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	NDUFB4	O95168	129 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	IFNA7	P01567	189 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	GPX1	P07203	203 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	NUPR2	A6NF83	97 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	UMAD1	C9J7I0	102 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	TEX46	H3BTG2	121 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	GCHFR	P30047	84 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	ERCC8	Q13216	396 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	ZFP69	Q49AA0	526 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	BAP18	Q8IXM2	172 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PKP4-208	ENST00000462335	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3

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