RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 WFDC1Q9HC57 220 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 EML5Q05BV3 1969 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SH2D1AO60880 128 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 E9PQ18 207 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 VWC2LB2RUY7 222 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CD55P08174 381 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 Q0VG73 95 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MSMBP08118 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 GUSBP1Q15486 140 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PSPNO60542 156 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 COLCA2A8K830 154 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PRSS46E5RG02 174 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFA4O00483 81 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 GLRX5Q86SX6 157 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PINLYPA6NC86 204 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ATP6V0BQ99437 205 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SLAQ13239 276 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LIME1Q9H400 295 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00473A8K010 186 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 I3L3M4 83 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SNAI2O43623 268 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF124Q15973 351 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CSTL1Q9H114 145 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C15orf62A8K5M9 175 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 Q0VFX4 171 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF876PQ49A33 203 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 GLMPQ8WWB7 406 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ESDP10768 282 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SAA4P35542 130 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CFHR2P36980 270 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 EFNA2O43921 213 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MMP23AO75900 390 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 EREGO14944 169 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 TNFRSF6BO95407 300 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 H3BQ85 93 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 K7ENP7 123 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 CDKN1BP46527 198 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf159Q96HA4 380 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LINC01619G3V211 115 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MLNRO43193 412 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 EVI2AP22794 236 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 C2orf82Q6UX34 121 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 RBAKDNA6NC62 111 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PPI3 338 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 A6NNC1 897 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRT-201ENST00000356100 FCN3O75636 299 aa4.87□□□□□ -1.63
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