RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 Q8N1Y9 231 aa20.64■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 CMTM2Q8TAZ6 248 aa20.64■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 RXFP4Q8TDU9 374 aa20.64■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 CST9LP1Q5W188 147 aa20.63■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 GGTLC3B5MD39 225 aa20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 FOXI2Q6ZQN5 318 aa20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 C5orf17Q8NAS9 161 aa20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 WFDC10AQ9H1F0 79 aa20.62■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 NOTCH1P46531 2555 aa20.61■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 EBLN2Q6P2I7 272 aa20.61■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa20.61■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 RGS13O14921 159 aa20.6■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB125Q8N687 156 aa20.6■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF124Q15973 351 aa20.59■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 CLLU1Q5K131 121 aa20.59■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 TXNDC17Q9BRA2 123 aa20.59■□□□□ 0.89
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GIPC1-201ENST00000345425 TCEAL7Q9BRU2 100 aa20.59■□□□□ 0.89
GIPC1-201ENST00000345425 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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GIPC1-201ENST00000345425 HAGHQ16775 308 aa20.57■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 OR10J6PQ8NGY7 276 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 KNCNA6PVL3 124 aa20.57■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 STHQ8IWL8 128 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.57■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 EPDR1Q9UM22 224 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 RPH3ALQ9UNE2 315 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa20.57■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 DIRC3C9JPN6 131 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 PRAC2D3DTV9 90 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 GDF5OSQ5U4N7 250 aa20.56■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 CITED4Q96RK1 184 aa20.55■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 RBFOX3A6NFN3 312 aa20.54■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 HIST1H2BAQ96A08 127 aa20.54■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa20.54■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 TCRAP04437 139 aa20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 ATG101Q9BSB4 218 aa20.54■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa20.53■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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GIPC1-201ENST00000345425 LINC00477Q96M19 166 aa20.49■□□□□ 0.87
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GIPC1-201ENST00000345425 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 SCO2A0A1W2PP80 73 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 A8MTW9 85 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 IGKV3-20P01619 116 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 ERCC8Q13216 396 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa20.47■□□□□ 0.87
GIPC1-201ENST00000345425 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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