RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 SLAQ13239 276 aa7.61□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 ZNF329Q86UD4 541 aa7.61□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 GAGE7O76087 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 GAGE12FP0CL80 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 GAGE12GP0CL81 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 GAGE12IP0CL82 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 FGF6P10767 208 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 TMEM219Q86XT9 240 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 A0A1W2PPM0 123 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 NDPQ00604 133 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 THBDP07204 575 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 SAP25Q8TEE9 199 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 LRRK2Q5S007 2527 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 IGHG2P01859 326 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 PRB1P04280 392 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 FAM27E3Q08E93 113 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 ETDBQ3ZM63 59 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 HLA-DMBP28068 263 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 ID3Q02535 119 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 CEND1Q8N111 149 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 Q86TA4 180 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 K7ERJ3 54 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 I3L3M4 83 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS1-201ENST00000171887 CTSBP07858 339 aa7.59□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 KLRD1Q13241 179 aa7.59□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 A0A0A6YYD4 124 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 REG4Q9BYZ8 158 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 LIME1Q9H400 295 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 SMIM10Q96HG1 83 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TMEM243Q9BU79 118 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 J3KT08 172 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 PFN2P35080 140 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 CFHR2P36980 270 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 WBP1Q96G27 269 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 PDE6HQ13956 83 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 USMG5Q96IX5 58 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 A0A1B0GWJ7 208 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 FAM223BA6NKX1 122 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 SYNJ2BPP57105 145 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 POU2AF1Q16633 256 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 NPSP0C0P6 89 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 SLC25A16P16260 332 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TFF1P04155 84 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 DEFB130BP0DP73 79 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 DEFB130AP0DP74 79 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 BAALCQ8WXS3 180 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 TIAF1O95411 115 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 LYZL4Q96KX0 146 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 Q0VG73 95 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 CRYBA4P53673 196 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 METRNQ9UJH8 293 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS1-201ENST00000171887 B5MCH6 92 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 188.3 ms