RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM190Q8WZ59 177 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF503Q96F45 646 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A2Q9BXI2 301 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM14CQ9P0S9 112 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DOK5Q9P104 306 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T8A6NH00 312 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TGOLN2O43493 480 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE4O60829 102 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCYAP1P18509 176 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TPPP2P59282 170 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SOHLH1Q5JUK2 328 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRDL1Q9BU40 450 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51M1Q9H341 326 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE6DO43924 150 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CD81P60033 236 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 LYZP61626 148 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RELQ04864 619 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SVBPQ8N300 66 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ELOVL1Q9BW60 279 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 S4R3C0 116 aa18.16■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PRE2 83 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 IL4P05112 153 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 IQCF2Q8IXL9 164 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PAXXQ9BUH6 204 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7C2O60412 319 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 APOC3P02656 99 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR183P32249 361 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 MORN5Q5VZ52 161 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC19AQ6UXS0 136 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 UHRF2Q96PU4 802 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV5A0A0B4J249 113 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM74A7A6NL05 159 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf94C9JXX5 98 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 F6UZH7 168 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BRN7 92 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-23P01764 117 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM74A3Q4VXF1 159 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RETNQ9HD89 108 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 BMPR1BO00238 502 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF414Q96IQ9 312 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFA5Q01523 94 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM20LQ6UXN7 152 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FXYD5Q96DB9 178 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL7Q9BRU2 100 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 IZUMO1RA6ND01 250 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9G4Q8NGQ1 327 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFAND3Q9H8U3 227 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAPINO95295 136 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CSN3P07498 182 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CST9LP1Q5W188 147 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM90A2PQ658T7 463 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RABAC1Q9UI14 185 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT2AQ03164 3969 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF98A6NK75 572 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV12-3P01733 135 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL3P36405 182 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNJ2BPP57105 145 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HERC2O95714 4834 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA4O00483 81 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NBEAP1P0C6P0 100 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf194Q5T5A4 169 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf52Q96A22 123 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2G2P60604 165 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCA2BQ16661 112 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM110AQ9BQ89 295 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GGCTO75223 188 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 OR10J4P0C629 311 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5G3P48201 142 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LYPD1Q8N2G4 141 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR82Q96P67 336 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 U3KQE9 123 aa18.05■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PYYP10082 97 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL7P18124 248 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CLRN3Q8NCR9 226 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAH10Q8IVF4 4471 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBB3P26998 211 aa18.04■□□□□ 0.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBA4BQ9H853 241 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms