RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 PPT1P50897 306 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R45P59539 299 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RHOGP84095 191 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF90Q03938 601 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf32Q32M92 178 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FUT9Q9Y231 359 aa6.86□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 RD3LP0DJH9 198 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 EDN2P20800 178 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PEA15Q15121 130 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 SSX7Q7RTT5 188 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 ZNF575Q86XF7 245 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00052Q96N35 136 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RARRES2Q99969 163 aa6.85□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.85□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 PPP5D1E7EU14 171 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 IFNA1P01562 189 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-48P01763 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf88P0DMB2 117 aa6.84□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PSG1P11464 419 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 GUK1Q16774 197 aa6.84□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.83□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 Q8WTZ3 238 aa6.83□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.83□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 RTL8CO15255 209 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TGOLN2O43493 480 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC3BP05452 202 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 GCHFRP30047 84 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ARL3P36405 182 aa6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 SEC11CQ9BY50 192 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.82□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR2T8A6NH00 312 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM250H0YL14 139 aa6.81□□□□□ -1.32
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