RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 C14orf144Q96I85 54 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 VWC2LB2RUY7 222 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFS8O00217 210 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 SPINK4O60575 86 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 CTSGP08311 255 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PS18 150 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 RAB9AP51151 201 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.54□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 GTSF1Q8WW33 167 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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