RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM230Q96A57 120 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM80Q96HE8 168 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC01587Q99440 93 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM59Q9BXS4 323 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 DOK5Q9P104 306 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 AK3Q9UIJ7 227 aa2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
ECHDC1-211ENST00000460558 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 XKRY2A2RUG3 117 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 A8MTW9 85 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 F6UB75 175 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GNGT2O14610 69 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM50AO95807 157 aa2.52□□□□□ -2.01
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ECHDC1-211ENST00000460558 TAS2R31P59538 309 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 LAGE3Q14657 143 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC01556Q5JQF7 62 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 AMTNQ6UX39 209 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SYS1Q8N2H4 156 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 MS4A15Q8N5U1 240 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 OR8J1Q8NGP2 316 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM56Q96MV1 263 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 DCSTAMPQ9H295 470 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2.52□□□□□ -2.01
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ECHDC1-211ENST00000460558 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa2.52□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 ISLRO14498 428 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 EDF1O60869 148 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CD37P11049 281 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SLAQ13239 276 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 POU2AF1Q16633 256 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 C14orf177Q52M58 125 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf73Q69YU5 71 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 HS3ST5Q8IZT8 346 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 OR11H7Q8NGC8 314 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 BAALCQ8WXS3 180 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.51□□□□□ -2.01
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ECHDC1-211ENST00000460558 PRO0255Q9UI72 69 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.51□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM231BA6NCW3 169 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SNTNA6NMZ2 147 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 H7BYZ3 331 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 J3QRE1 110 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TAAR5O14804 337 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF253O75346 499 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 PITX3O75364 302 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SCGNO76038 276 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 HPRT1P00492 218 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 LALBAP00709 142 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK1P06493 297 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SAMD13Q5VXD3 122 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 UFSP1Q6NVU6 142 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 Q6ZTI0 123 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 C7orf33Q8WU49 177 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 VGLL1Q99990 258 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.5□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM235A6NFC5 223 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 H0Y8G0 127 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 H7C1H1 209 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 PHOX2AO14813 284 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 SNAPC5O75971 98 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-DQB1P01920 261 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYBA4P53673 196 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN12P56749 244 aa2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
ECHDC1-211ENST00000460558 CATR1Q13166 79 aa2.49□□□□□ -2.01
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