RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC3BP05452 202 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CRYBA1P05813 215 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5G2Q06055 141 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PDE6HQ13956 83 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ELOBQ15370 118 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ADIRFQ15847 76 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 Q8N2B8 174 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM86BQ8N661 226 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 OCC1Q8TAD7 63 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf77Q96MU5 243 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 IMMP2LQ96T52 175 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SPXQ9BT56 116 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 OTORQ9NRC9 128 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 EPDR1Q9UM22 224 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 S4R3C0 116 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.64□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087X0K7 114 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF320A2RRD8 509 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 HELTA6NFD8 242 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 K7EN84 100 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 BMPR1BO00238 502 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PEX7O00628 323 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R2P9O14990 202 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CD5LO43866 347 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF253O75346 499 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 GCGP01275 180 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-23P01764 117 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RAB5AP20339 215 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PSMB8P28062 276 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 S100A7P31151 101 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 GPR183P32249 361 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RAB9AP51151 201 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 LEMD1Q68G75 181 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TEX38Q6PEX7 206 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 FAM24BQ8N5W8 94 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RNF152Q8N8N0 203 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SMIM12Q96EX1 92 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 Q9H3A6 140 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RABAC1Q9UI14 185 aa4.63□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CENPEQ02224 2701 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PDZD2O15018 2839 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0G2JLM5 398 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PGPA6NDG6 321 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 H7BYZ3 331 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ISLRO14498 428 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 PHOX2AO14813 284 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 BUB3O43684 328 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TRGV3P03979 118 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TCRAP04437 139 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TYMSP04818 313 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CXCL1P09341 107 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 GNG4P50150 75 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 RANP62826 216 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 FOXL1Q12952 345 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CENPWQ5EE01 88 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SFRP2Q96HF1 295 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 GPR82Q96P67 336 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A10Q96PG2 267 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ATG101Q9BSB4 218 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 MLST8Q9BVC4 326 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 KLK15Q9H2R5 256 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF702PQ9H963 129 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 OSTCQ9NRP0 149 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM160Q9NX00 188 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00527Q9UJ94 153 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.62□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.61□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.61□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 SLC17A3O00476 420 aa4.61□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFA4O00483 81 aa4.61□□□□□ -1.67
C6orf48-208ENST00000395788 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.2 ms