RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 HbzP06467 142 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lef1P27782 397 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 AtraidQ6PGD0 223 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ankrd55Q8BLD6 626 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Aqp6Q8C4A0 293 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dctn4Q8CBY8 467 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr638Q8VH20 321 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Eif3fQ9DCH4 361 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cd5lQ9QWK4 352 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hnf4gQ9WUU6 408 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 St6galnac3Q9WUV2 305 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr920E9Q413 310 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 G530012D18RikJ3QK25 139 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Onecut1O08755 465 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pax1P09084 446 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 P18529 117 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm10775Q3V290 127 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nup62Q63850 526 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lhfpl1Q80SV1 220 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Smim8Q9CQQ0 97 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Eaf1Q9D4C5 268 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ap1s2Q9DB50 160 aa14.57□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm21095A0A087WR14 222 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm43191F6YIH5 235 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm10269G3UWD7 123 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pdlim4P70271 330 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dlx6P70397 175 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Col8a1Q00780 744 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zfp92Q62396 488 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prickle3Q80VL3 624 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam168aQ8BGZ2 244 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpp21Q8R040 150 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 HpxQ91X72 460 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lelp1Q9DAE3 120 aa14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 P06335 190 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ca5aP23589 299 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr139Q60891 315 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rab39bQ8BHC1 213 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Plekha2Q9ERS5 425 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nubp1Q9R060 320 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vmn1r5B2RQT2 315 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hyal2O35632 473 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hoxa3P02831 443 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Svs5P30933 122 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc39a7Q31125 476 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem18Q3TUD9 140 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ccsmst1Q6RUT7 136 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr736Q8VFT6 312 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pbp2Q8VIN1 187 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Elovl1Q9JLJ5 279 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 RhcgQ9QXP0 498 aa14.55□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv5-2A0A0A6YVX8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Arl16B1ATY8 173 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prss32E9Q409 334 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nudt10P0C027 164 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nudt11P0C028 164 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hist1h1eP43274 219 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl30P62889 115 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dlx4P70436 240 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Defb2P82020 71 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Foxn4Q8K3Q3 521 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Actl6bQ99MR0 426 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 H2afb1Q9CQ70 111 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gins1Q9CZ15 196 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm28778A0A087WSK7 233 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 D930048N14RikA2AA67 225 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm37988J3QM41 62 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 AipO08915 330 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gcm1P70348 436 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 CebpdQ00322 268 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pate4Q09098 99 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mettl4Q3U034 471 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr193Q7TS43 309 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr136Q8VG72 312 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pttg1Q9CQJ7 199 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem50aQ9CXL1 157 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 RprmQ9JJ72 109 aa14.53□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Trav18A0A075B656 109 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm20877J3QPZ4 227 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q08AU9 97 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc2a9Q3T9X0 538 aa14.52□□□□□ -0.08
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.8 ms