Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
P06335 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
P06335 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
P06335 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P06335 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
P06335 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P06335 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
P06335 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P06335 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P06335 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P06335 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P06335 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
P06335 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P06335 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P06335 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P06335 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P06335 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P06335 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
P06335 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P06335 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P06335 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
P06335 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P06335 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P06335 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P06335 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P06335 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P06335 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P06335 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P06335 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P06335 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P06335 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
P06335 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P06335 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P06335 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P06335 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P06335 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P06335 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P06335 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P06335 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P06335 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P06335 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P06335 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P06335 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P06335 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P06335 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P06335 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P06335 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P06335 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P06335 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P06335 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P06335 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P06335 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P06335 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P06335 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P06335 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P06335 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P06335 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P06335 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P06335 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P06335 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06335 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P06335 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P06335 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06335 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P06335 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06335 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P06335 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P06335 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P06335 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P06335 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P06335 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06335 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06335 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P06335 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P06335 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P06335 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06335 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06335 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06335 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06335 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06335 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06335 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06335 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06335 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06335 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06335 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06335 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06335 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06335 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06335 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P06335 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P06335 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P06335 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P06335 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P06335 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06335 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P06335 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P06335 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06335 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P06335 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms