RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PPV4 95 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF320A2RRD8 509 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MZ25 164 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA4O00483 81 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 HYPMO75409 117 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2C1O95371 312 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 ADMP35318 185 aa8.73□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 TEX261Q6UWH6 196 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR11H1Q8NG94 326 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF125Q96EQ8 232 aa8.73□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 RAX2Q96IS3 184 aa8.73□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.73□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.73□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 I3L521 148 aa8.72□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 GP9P14770 177 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 M6PRP20645 277 aa8.72□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRR20EP86478 221 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR20CP86479 221 aa8.72□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRR20AP86496 221 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 PMS2P11Q13670 270 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF141Q8WVD5 230 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 METTL26Q96S19 204 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 RABAC1Q9UI14 185 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.72□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 MYCBP2O75592 4640 aa8.71□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 TEX46H3BTG2 121 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 BMI1P35226 326 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PLP1P60201 277 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB2AP61019 212 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RHOBP62745 196 aa8.71□□□□□ -1.02
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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CAPNS1-209ENST00000590049 GPHB5Q86YW7 130 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 C18orf15Q96N68 181 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PEMTQ9UBM1 199 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.71□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 NPPCP23582 126 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SULT1A2P50226 295 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R45P59539 299 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM78BQ5VT40 261 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RETNQ9HD89 108 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RFNGQ9Y644 331 aa8.7□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PS18 150 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SYNJ2BPP57105 145 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 BLOC1S1P78537 153 aa8.69□□□□□ -1.02
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CAPNS1-209ENST00000590049 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 LGALS9O00182 355 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SLURP1P55000 103 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KHDC3LQ587J8 217 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 VSIRQ9H7M9 311 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.68□□□□□ -1.02
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