RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 FBXL15Q9H469 300 aa14.69□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 IZUMO1RA6ND01 250 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 IGLC1P0CG04 106 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 GP9P14770 177 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 CRISP2P16562 243 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 ORM2P19652 201 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 CD24P25063 80 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 RANP62826 216 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 IQCJQ1A5X6 159 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 BAGE2Q86Y30 109 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMEM160Q9NX00 188 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 IGHV3-48P01763 117 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 HLA-DQA1P01909 254 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 AMY1AP04745 511 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 IER3P46695 156 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 MMDQ15546 238 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 RNF24Q9Y225 148 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 SNURFLB1AK76 121 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 HES1Q14469 280 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.67□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 FOSL1P15407 271 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMEM11P17152 192 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 PLGLAQ15195 96 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 FMC1Q96HJ9 113 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 ATG101Q9BSB4 218 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 C1RLQ9NZP8 487 aa14.66□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TOMM40O96008 361 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TPPP2P59282 170 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 RAB4BP61018 213 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 DEFA6Q01524 100 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 GPR82Q96P67 336 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 DDTP30046 118 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 UBE2G1P62253 170 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 CT83Q5H943 113 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 Q8N9W7 124 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 TMEM68Q96MH6 324 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 MLST8Q9BVC4 326 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 ZNF492Q9P255 531 aa14.65□□□□□ -0.06
LRP1-204ENST00000553277 HIVEP1P15822 2718 aa14.65□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 PGPA6NDG6 321 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 A6NDX4 124 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 CNIH1O95406 144 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 PSG1P11464 419 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 FXYD3Q14802 87 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 FAM209BQ5JX69 171 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 S100A7AQ86SG5 101 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 LINC00479Q96M42 142 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 OTORQ9NRC9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.64□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 K7EIM0 57 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 Q6YL49 198 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 NUDT11Q96G61 164 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 MS4A10Q96PG2 267 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.63□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 HIVEP2P31629 2446 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 IGKV1-17P01599 117 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 REC114Q7Z4M0 266 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 TSKUQ8WUA8 353 aa14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 H3BUX3 64 aa14.61□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 NUPR1O60356 82 aa14.61□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 LTAP01374 205 aa14.61□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 HLA-DRB1P01911 266 aa14.61□□□□□ -0.07
LRP1-204ENST00000553277 TCRAP04437 139 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms