RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 ASCL4Q6XD76 172 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 ITGB1BP1O14713 200 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM27E3Q08E93 113 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM133Q9H2Q1 129 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 F8W1H4 67 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-207ENST00000503393 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TRGV9Q99603 122 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C9JAW5 83 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 FAM231BA6NCW3 169 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A0U1RRA0 63 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C9orf118A6NHY6 69 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 GATD1Q8NB37 220 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 RFNGQ9Y644 331 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 CCL3L1P16619 93 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TCRAP04437 139 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM8BA6NDV4 472 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV1-5P01602 117 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 K7EP13 123 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGHV2-5P01817 119 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 HGFACQ04756 655 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 SPANXDQ9BXN6 97 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LINC00158P58513 81 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TOMM40O96008 361 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 DENND4CQ5VZ89 1909 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV1D-12P01611 117 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LINC01560Q8TB33 94 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PF4P02776 101 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM158Q8WZ71 300 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 OVOL1O14753 267 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 VCYO14598 125 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 NPC2P61916 151 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 FNDC10F2Z333 226 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF138P52744 262 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 ATP6V0BQ99437 205 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 SCRT1Q9BWW7 348 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 JPT2Q9H910 190 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TNFRSF14Q92956 283 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TEX43Q6ZNM6 134 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C9JQL5 133 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LEPROTO15243 131 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 FXYD7P58549 80 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 MST1LQ2TV78 715 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 STPG4Q8N801 248 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGLC2P0DOY2 106 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGLC3P0DOY3 106 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 QRFPP83859 136 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 CRYGSP22914 178 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 NTF4P34130 210 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 H3BMM0 161 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PAX4O43316 350 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 UBE2WQ96B02 151 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IGLV3-19P01714 112 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 IFITM1P13164 125 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PEMTQ9UBM1 199 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 PAX8Q06710 450 aa12.83□□□□□ -0.35
SH3BP2-207ENST00000503393 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 BMPERQ8N8U9 685 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 FOXF2Q12947 444 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 SPSB3Q6PJ21 355 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 Q6ZS49 121 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-207ENST00000503393 CT83Q5H943 113 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms