RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RBP4P02753 201 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 MT-ND6P03923 174 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PRR27Q6MZM9 219 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 KIR3DL3Q8N743 410 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TIMD4Q96H15 378 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 DPM3Q9P2X0 92 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SPG11Q96JI7 2443 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PIEZO1Q92508 2521 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PSG1P11464 419 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 MYCNOSP40205 109 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 LYZP61626 148 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NIT1Q86X76 327 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 I3L2K1 104 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 BMPR1BO00238 502 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 AMY1AP04745 511 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CFHR4Q92496 578 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 IGLC1P0CG04 106 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TSPOP30536 169 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 COTL1Q14019 142 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 HES1Q14469 280 aa10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CORTO00230 105 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 APCSP02743 223 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SLAQ13239 276 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SPATA12Q7Z6I5 190 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 EPDR1Q9UM22 224 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 VPS13CQ709C8 3753 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TOX4O94842 621 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DQA1P01909 254 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 GP9P14770 177 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NUDT11Q96G61 164 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 FLNCQ14315 2725 aa10.18□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 H0Y8G0 127 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-17P01599 117 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TSKUQ8WUA8 353 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 KCNS1Q96KK3 526 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 K7EIM0 57 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NBR2O15453 112 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 VAMP3Q15836 100 aa10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PRTN3P24158 256 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 COX11Q9Y6N1 276 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 UBE2V1Q13404 147 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 COX19Q49B96 90 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 RNF5Q99942 180 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 ODF3BA8MYP8 253 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 IGLL1P15814 213 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CAMPP49913 170 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 VMO1Q7Z5L0 202 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 MBD6Q96DN6 1003 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 Q9H3A6 140 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PLP1P60201 277 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 UBE2G1P62253 170 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 EBLN2Q6P2I7 272 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 BORCS7Q96B45 105 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 C17orf77Q96MU5 243 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 UQCRFS1P47985 274 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 TCTAP57738 103 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 PAX2Q02962 417 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 MPV17L2Q567V2 206 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NUP35Q8NFH5 326 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ASCL2Q99929 193 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 VPS25Q9BRG1 176 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.15□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 ZFHX3Q15911 3703 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 VWC2LB2RUY7 222 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 M0R1W7 72 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 NDPQ00604 133 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 GDF5OSQ5U4N7 250 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAME-213ENST00000492657 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms