RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 ZFP82Q8N141 532 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 HARBI1Q96MB7 349 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.24□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 A0A087WWC5 75 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 PPP5D1E7EU14 171 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 UPK2O00526 184 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 KBTBD11O94819 623 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 FOLR2P14207 255 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 RAB5AP20339 215 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 OPRK1P41145 380 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ZNF726P1Q15940 193 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 AARDQ4LEZ3 155 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SMUG1Q53HV7 270 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 RAB24Q969Q5 203 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ISOC2Q96AB3 205 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 NAT8Q9UHE5 227 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.23□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 FAM223BA6NKX1 122 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 COLCA2A8K830 154 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 NDUFB8O95169 186 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 S100PP25815 95 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 RHOBP62745 196 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 PRCDQ00LT1 54 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 ADIRFQ15847 76 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 POU2AF1Q16633 256 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 CST9LP1Q5W188 147 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 TEPPQ6URK8 271 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 OR5B3Q8NH48 314 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 OR4A5Q8NH83 315 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SLC35E1Q96K37 410 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 BET1LQ9NYM9 111 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.22□□□□□ -1.25
NOP56-215ENST00000490753 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 F6UZH7 168 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TMEM250H0YL14 139 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 CXorf1O96002 111 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 B2MP61769 119 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 ATP5G2Q06055 141 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TNXAQ16473 311 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 PRSS8Q16651 343 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 DEFB135Q30KP9 77 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TMEM177Q53S58 311 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 SSX7Q7RTT5 188 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.21□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TMEM213A2RRL7 107 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 C11orf94C9JXX5 98 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 FNDC10F2Z333 226 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 LGALS9O00182 355 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 TGOLN2O43493 480 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 PDE6DO43924 150 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 PAGE4O60829 102 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 OR2J3O76001 311 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 ACTL6BO94805 426 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 BMI1P35226 326 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 C15orf32Q32M92 178 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 MIC13Q5XKP0 118 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 LGALS9CQ6DKI2 356 aa7.2□□□□□ -1.26
NOP56-215ENST00000490753 NECAP1Q8NC96 275 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms