RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB5CP51148 216 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGN3Q15651 99 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 NNATQ16517 81 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 C4orf26Q17RF5 130 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2M3Q8NG83 312 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 STOML3Q8TAV4 291 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 THEM6Q8WUY1 208 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 PFDN5Q99471 154 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC11CQ9BY50 192 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 BCL2L14Q9BZR8 327 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR51I1Q9H343 314 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXL15Q9H469 300 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM223A0PJW6 202 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 GGT3PA6NGU5 568 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR31O00270 319 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 PDCD6O75340 191 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 RBBP9O75884 186 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA10P01566 189 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV1-39P01597 117 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 C1QCP02747 245 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV1D-39P04432 117 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CD2P06729 351 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 UCHL1P09936 223 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF688P0C7X2 276 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR12D1P0DN82 309 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A4P12235 298 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TAS2R41P59536 307 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 NAA40Q86UY6 237 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5J2Q8NH18 312 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 FXYD5Q96DB9 178 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 PARP11Q9NR21 331 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CALML5Q9NZT1 146 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.56□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 A6NIN4 97 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 RIIAD1A6NNX1 92 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 C8orf87E5RJ46 101 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 F5H5K5 113 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 J3QLW9 94 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 UPK2O00526 184 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IGF2P01344 180 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 IFNA17P01571 189 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-DQA1P01909 254 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 MT-ND4LP03901 98 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAIN1P0CW23 69 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ATF1P18846 271 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 S100A2P29034 98 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 PMELP40967 661 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 DNLZQ5SXM8 178 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 MKXQ8IYA7 352 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP82Q8N141 532 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC26A10Q8NG04 563 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.55□□□□□ -1.84
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.55□□□□□ -1.84
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