RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 C19orf84I3L1E1 186 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 TOX4O94842 621 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM11P17152 192 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 NUP35Q8NFH5 326 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 PTPN13Q12923 2485 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV2-11P01706 119 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 Q8N9W7 124 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRF-212ENST00000477970 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 BMPR1BO00238 502 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 COX6B1P14854 86 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 NDPQ00604 133 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 SERF1AO75920 110 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRF-212ENST00000477970 S100A7P31151 101 aa9.59□□□□□ -0.87
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PTPRF-212ENST00000477970 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRF-212ENST00000477970 A8MWL6 223 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 GNB4Q9HAV0 340 aa9.58□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 NEU1Q99519 415 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 KCNS1Q96KK3 526 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 BAGE3Q86Y29 109 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PRM7 423 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.57□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 K7EQM0 130 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 P01737 135 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 DEFA6Q01524 100 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 REC114Q7Z4M0 266 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 ATP6V0BQ99437 205 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 A8MWP6 167 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZWC4 215 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 PSG3Q16557 428 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 HBBP68871 147 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 PAX8Q06710 450 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 SLAQ13239 276 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 PRR27Q6MZM9 219 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
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PTPRF-212ENST00000477970 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 DIRC3C9JPN6 131 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 NPFFO15130 113 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 SAA4P35542 130 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 SLC35B1P78383 322 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRF-212ENST00000477970 Q56UQ5 140 aa9.54□□□□□ -0.88
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