RNA–Protein interactions for RNA: YHR187W

IKI1, Transcript of Subunit of hexameric RecA-like ATPase Elp456 Elongator subcomplex, yeast

Gene IKI1, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKI1	YHR187W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.28	□□□□□ -1.72
IKI1	YHR187W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.28	□□□□□ -1.72
IKI1	YHR187W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.28	□□□□□ -1.72
IKI1	YHR187W	BNR1	P40450	1375 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	SEC12	P11655	471 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	HOP1	P20050	605 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	VPS33	P20795	691 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	CNE1	P27825	502 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	EHT1	P38295	451 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	CPR8	P53728	308 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	TGS1	Q12052	315 aa		4.27	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	STE12	P13574	688 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PLC1	P32383	869 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	LOT5	P34234	306 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	STL1	P39932	569 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YIP4	P53093	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YGL117W	P53133	265 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	IMO32	P53219	342 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	TRS23	Q03784	219 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	SLX4	Q12098	748 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.26	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	VPS34	P22543	875 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	FLO10	P36170	1169 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	MDR1	P53258	950 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	USA1	Q03714	838 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PHM6	Q05637	104 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ULA1	Q12059	462 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.25	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	WHI2	P12611	486 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	TFC4	P33339	1025 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	CCL1	P37366	393 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	RIM4	P38741	713 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	EAF5	P39995	279 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	MNT2	P53059	558 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	COQ6	P53318	479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	BUD17	P53727	317 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YML122C	Q03207	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ARG7	Q04728	441 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	HOS1	Q12214	470 aa		4.24	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YMC1	P32331	307 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	DSS4	P32601	143 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YNL018C	P53976	612 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PMA2	P19657	947 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PEX2	P32800	271 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	TAF5	P38129	798 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	MAD2	P40958	196 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	TRI1	Q05024	226 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	PSF3	Q12146	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IKI1	YHR187W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	PCK1	P10963	549 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	BET2	P20133	325 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	AAD3	P25612	363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	TOM20	P35180	183 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	SDS22	P36047	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	YIL092W	P40497	633 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	YNR071C	P53757	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	FMP30	Q02883	468 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	DIN7	Q12086	430 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	CBP3	P21560	335 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	ARG1	P22768	420 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	ORC2	P32833	620 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	YPT10	P38146	199 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	SAP4	P53036	818 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	OSW1	Q08692	278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	URA3	P03962	267 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	AAC1	P04710	309 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	PHO3	P24031	467 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	TGL1	P34163	548 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	SAW1	P39735	261 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	OPT1	P40897	799 aa		4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	MRPL9	P31334	269 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	YLF2	P38746	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	GSM1	P42950	618 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	THI7	Q05998	598 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RPC34	P32910	317 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKI1	YHR187W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74

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