RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 SNAPC2Q13487 334 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 FAM151AQ8WW52 585 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 WRNIP1Q96S55 665 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.6■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 DCAF15Q66K64 600 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 C17orf99Q6UX52 265 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.59■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 CIAO1O76071 339 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 PRMT2P55345 433 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 NBPF11Q86T75 865 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.58■□□□□ 0.89
CLN3-255ENST00000637100 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 BRCA2P51587 3418 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 SLC5A1P13866 664 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 MOGSQ13724 837 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.57■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 INPP5BP32019 993 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.56■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 MAP3K10Q02779 954 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.55■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 SEMA3EO15041 775 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 PRDX5P30044 214 aa20.54■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 CTGFP29279 349 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 NFIAQ12857 509 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.53■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 KIF22Q14807 665 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 ATP2B3Q16720 1220 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 IDI2Q9BXS1 227 aa20.52■□□□□ 0.88
CLN3-255ENST00000637100 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 CXCL11O14625 94 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 COPRSQ9NQ92 184 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 GAKO14976 1311 aa20.51■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 TRIM47Q96LD4 638 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SRRDQ9UH36 339 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.5■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 PDHXO00330 501 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 ENTPD3O75355 529 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 BCRP11274 1271 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 USP40Q9NVE5 1235 aa20.49■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 PHKA1P46020 1223 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 TCP10Q12799 353 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.48■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 PSMC4P43686 418 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 CPA4Q9UI42 421 aa20.47■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 OSBPP22059 807 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 MTX1Q13505 466 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 CCDC102BQ68D86 513 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SHISA4Q96DD7 197 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SIL1Q9H173 461 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.46■□□□□ 0.87
CLN3-255ENST00000637100 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 HOXD10P28358 340 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 RGS3P49796 1198 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 MTFR1Q15390 333 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.44■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 PTPRAP18433 802 aa20.43■□□□□ 0.86
CLN3-255ENST00000637100 ADORA1P30542 326 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms