RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	FAM83A	Q86UY5	434 aa		33	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	HOOK2	Q96ED9	719 aa		33	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	RAB11FIP3	O75154	756 aa		32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	FZD1	Q9UP38	647 aa		32.99	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	CA12	O43570	354 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	LDHC	P07864	332 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	SNRK	Q9NRH2	765 aa		32.98	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	MECOM	Q03112	1051 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K11	Q16584	847 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	ZIC5	Q96T25	663 aa		32.97	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		32.96	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	UNCX	A6NJT0	531 aa		32.95	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	TEPSIN	Q96N21	525 aa		32.95	■■■□□ 2.87
BRD4-208	ENST00000597315	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		32.95	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	GAK	O14976	1311 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		32.94	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	BTD	P43251	543 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	LBX1	P52954	281 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	FAM151A	Q8WW52	585 aa		32.93	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	TCP10	Q12799	353 aa		32.92	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	DCAF15	Q66K64	600 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	ZAP70	P43403	619 aa		32.9	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	CSRNP1	Q96S65	589 aa		32.89	■■■□□ 2.86
BRD4-208	ENST00000597315	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	NFIA	Q12857	509 aa		32.88	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		32.88	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	CSAD	Q9Y600	493 aa		32.88	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	IGSF3	O75054	1194 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	SREBF2	Q12772	1141 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	SPRYD7	Q5W111	196 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	TSKS	Q9UJT2	592 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K9	P80192	1104 aa		32.86	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.86	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ENTPD3	O75355	529 aa		32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	BAG3	O95817	575 aa		32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	RGS3	P49796	1198 aa		32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	PICALM	Q13492	652 aa		32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.85	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	WNK4	Q96J92	1243 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ELP3	Q9H9T3	547 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	TRPA1	O75762	1119 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF384	Q8TF68	577 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	WRNIP1	Q96S55	665 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		32.83	■■■□□ 2.85
BRD4-208	ENST00000597315	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	CRBN	Q96SW2	442 aa		32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	RNF186	Q9NXI6	227 aa		32.82	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	PLCG2	P16885	1265 aa		32.81	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	MAP3K12	Q12852	859 aa		32.81	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	INHBE	P58166	350 aa		32.8	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	VGLL4	Q14135	290 aa		32.8	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	TM4SF4	P48230	202 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	TEX11	Q8IYF3	940 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	OPTN	Q96CV9	577 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	DCTPP1	Q9H773	170 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	32.79	■■■□□ 2.84
BRD4-208	ENST00000597315	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.79	■■■□□ 2.84

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