RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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CAPNS1-209ENST00000590049 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.072e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-209ENST00000590049 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 F8W031 263 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-209ENST00000590049 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.61□□□□□ -0.07
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